Budowa trwała od początku XIV wieku do XV wieku. Kościół w stylu gotyckim został farą nowego miasta i do XVII wieku kilka razy zmienili się jego właściciele. Ma on rzadko spotykany dla tego obszaru kształt bazyliki a jego charakterystyczne zwieńczenie wieży zostało skonstruowane po pożarze w 1455. roku. Jest to najpiękniejszy kościół w Toruniu ze zdobioną wieżyczką schodową, ceramiczną inskrypcją przy podstawie i licznymi malowidłami maswerkowymi. Wnętrze jest wypełnione barokowymi ołtarzami, średniowiecznymi rzeźbami i gotyckimi malowidłami. Kościół ten jest ważnym punktem na drodze św. Jakuba na odcinku drogi polskiej.